通用型无缝克隆试剂盒
开泰自产
货号:AO4104

通用型无缝克隆试剂盒

货号 AO4104
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品名 通用型无缝克隆试剂盒
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AO4104 通用型无缝克隆试剂盒

开泰生物 | 高品质科研试剂

通用型无缝克隆试剂盒
货号AO4104
品名通用型无缝克隆试剂盒
规格100 rxn

产品介绍

常见问题解答 Q1:引物如何设计? A1:引物由三部分组成:同源臂(15-25 bp,不计算酶切位点和残留碱基,GC含量40%-65%)+酶切位点(按需保留或舍弃)+特异性引物(引物Tm值由特异性序列决定,计算Tm值不包括同源臂和酶切位点的序列)。 Q2: 平板上长不出克隆或克隆数目少 A2: 2.1 引物设计不正确:即同源臂序列选择不合适,应避免选择含有高级结构的同源序列。同源臂的大小应为15-25 bp(不包括酶切位点),且GC含量应在40%-65%。同源臂的长度小于13 bp或者大于35 bp时,重组效率低。 2.2 载体和外源DNA纯度较低:酶切或PCR扩增获得的载体/外源DNA片段应胶回收纯化,纯化的DNA应直接溶解于ddH 2 O中。 2.3 载体和外源DNA的摩尔比不佳:使用更精准的方法进行外源DNA和载体的定量(用Nanodrop的方法或琼脂糖凝胶电泳的方法进行定量)。 2.4 感受态转化效率低:使用高效感受态(10 8 CFU/μg以上),并将转化产物全部涂平板。 2.5 平板配置错误:选择错误的抗生素或在固体LB培养基中加入了过量抗生素。涂板时检查载体的抗性并选择正确的抗生素和浓度。 2.6 设置阳性对照:用于排查是否因操作原因、感受态效率下降、试剂酶活力下降而导致的重组效率低。 2.7 实验反应条件:建议水浴或PCR仪控温,温度不准会导致重组效率下降。 2.8 反应体系不合适:建议10 μL反应体系,若直接使用酶切产物或PCR产物进行重组反应时,添加的体积之和不能超过重组反应总体积的1/5,否则会降低重组效率。 2.9 转化体积过量:重组产物的转化体积不应该超过感受态细胞体积的1/10,否则会降低转化效率。 Q3:阳性对照不长克隆或长得很少 A3: 3.1 抗性使用错误。 3.2 感受态转化效率低:确保感受态转化效率>10 7 cfu/μg,即将1 ng质粒转化至100 μL感受态细胞中,取1/10进行涂板,生长1000个菌斑,估算感受态转化效率为10 7 cfu/μg; Q4:假阳性/空载体/测序无信号 A4: 4.1 载体线性化处理不完全:通过阴性对照检测载体是否线性化完全,如果阴性对照长了很多克隆,可能是模板加入量过多或线性化处理不完全,可优化酶切体系,提高限制内切酶使用量并延长酶切反应时间;或者更换效率更高的限制性内切酶;胶回收酶切产物。回收产物溶解于ddH 2 O中。 4.2 环型质粒模板残留导致假阳性:使用Dpn I除去含有甲基化修饰的环型质粒模板,模板投入量不宜过多(<1 ng),否则可能导致Dpn I消化不完全从而造成假阳性;胶回收酶切产物。回收产物溶解于ddH 2 O中。 4.3 连入非目的片段:PCR扩增获得外源DNA片段时,产生非特异片段,建议胶回收PCR产物,回收产物溶解于ddH 2 O中。 Q5:大多数克隆含有不正确片段 A5: 5.1 PCR扩增外源片段不特异:优化PCR扩增体系,提高特异性;胶回收PCR产物;重新设计引物;挑取更多的克隆鉴定。 5.2 反应体系中混入相同抗性的质粒:PCR扩增模板为环状质粒时,扩增产物应进行Dpn I处理或胶回收纯化。 5.3 反应体系中混入了其它序列:进一步纯化PCR产物,排除PCR产物不纯等因素造成的影响;使用干净的耗材,ddH 2 O等,避免试剂或耗材带来的污染。 5.4 测序样本数太少:需要多挑几个样本测序。 Q6:菌落或菌液PCR无条带 A6: 6.1 PCR体系或程序不合适:用载体引物进行菌落PCR鉴定时,没有目的条带也没有空载体条带,则说明PCR体系

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